V lidském těle byl nalezen super-rozšířený virus, o kterém jsme dosud nevěděli

Vědci právě oznámili objev nového, neuvěřitelně běžného viru, který žije uvnitř lidských střevních bakterií. To je nazýváno "crAssphage" a je téměř šestkrát častější než všechny ostatní bakteriální viry v kombinaci. Ale jak jsme si ho tak dlouho nevšimli?

Důvodem, proč jsme předtím nenašli crAssphage, je to, že jsme nevěděli, že bychom to měli hledat. To to znamená.

I když se nové technologie sekvencování stávají rychlejšími a levnějšími, stále mají jednu slabost: jsou dobré při hledání věcí, o nichž už víme, ale nejsou dobré při hledání nových organismů. Když vědci studují organický vzorek, dostanou polévku z DNA fragmentů všech živých věcí, které se týkají tohoto vzorku - bakterie, viry a samotnou osobu. Pak je třeba tyto fragmenty sestavit do sekvencí, které můžeme identifikovat. Pokud nalezneme řetězec specifický pro genom určité bakterie, znamená to, že jsme tuto bakterii našli ve vzorku..

Problém je v tom, že pokud ještě neznáme sekvenci viru, která je nám neznámá, nemůžeme ji pomocí této techniky zjistit. Ve skutečnosti autor nové studie crAssphage, Bass Datil, uvádí, že je neznámých téměř 75% sekvencí DNA ve vzorcích, které studovali..

Tým Datila dokázal najít nový virus pomocí zcela odlišného přístupu založeného na jednoduché myšlence: fragmenty, které se znovu a znovu nacházejí ve stejném vzorku, jsou častěji součástí stejného genomu. Použili techniku ​​tzv. Cross-assembly k identifikaci jedné takové skupiny opakovaných sekvencí ve vzorcích odebraných od 12 lidí. Tyto sekvence pak sestavily do jediného genomu..

A dostali přesně to: crAssphage virus, pojmenovaný podle techniky křížové montáže, která vedla k jeho objevení. Zjistili, že crAssphage žije uvnitř Bacteroides - společné skupiny bakterií, které žijí v našich střevech..

V důsledku výzkumu našel tým crssphage v 75% střevních sekvencí lidí v USA, Evropě a Jižní Koreji. Ještě nevíme, co přesně tyto fágy dělají v našich střevech, ale určitě hrají určitou roli v našem střevním mikrobiálním ekosystému..

A konečně zajímavý fakt: vědci vypočítali, že v našem těle je přibližně 100krát více virových částic než ve skutečnosti lidské buňky. Takže máme ještě spoustu práce, abychom zjistili, co vlastně jsme..